当社迅速同定メニュー「Rapid解析」が新しくなりました。
～迅速性と正確性を兼ね備え、さらに皆様のご期待にお応えいたします。～
① 16S rDNA (ENKI BLAST) Rapid／26S rDNA (ENKI BLAST) Rapid
当社遺伝子解析メニューの内、最短の「2営業日報告」となります。
「どんな菌なのか？安全性は？」を迅速に知りたいというスピード最重視の方にお薦めのコースです。
報告内容は、当社微生物同定データベース「ENKI DB」に対するBLASTの結果です。「ENKI DB」は微生物の同定用に吟味したデータベースのため、相同性検索結果に対するデータの精査等は不要です。
検索された菌種名に対応するバイオセーフティレベルも出力されるため、検体の安全性評価にも役立ちます。
追加で「簡易分子系統解析」を実施することにより、当社標準報告書と同内容の報告にカスタマイズ可能です。
② 16S rDNA Rapid／26S rDNA Rapid／ITS rDNA Rapid 中間報告なし
従来のRapid解析の中間報告を省略し、価格を抑えたメニューとなります。
4営業日で当社標準報告書を発行いたします。
費用を抑えつつ迅速さと正確さをお求めの方にお薦めのコースです。
相同性検索に加え、簡易分子系統解析の結果も考慮しますので、より精度高い同定が可能です。標準で帰属種・近縁種のバイオセーフティレベルが付くほか、ご希望の方には分離源情報もお付けいたします。
これまでご利用頂いていた3営業日中間報告、4営業日正式報告のRapid解析については引き続きご利用頂けます。
Rapid解析の各コースに関する仕様は、下表を参照ください。
| 試験項目 | 目安納期 | 中間報告 | 相同性検索塩基配列データベース | 簡易分子系統解析 | BSL/分離 |
|---|---|---|---|---|---|
| 細菌: 16S-500 (ENKI BLAST) Rapid | 2営業日 | なし | ENKI DB-BA | なし | あり／なし |
| 酵母: 26S rDNA-D1/D2 (ENKI BLAST) Rapid | ENKI DB-FU | あり／あり | |||
| 細菌: 16S-500 Rapid | 4営業日 | 3営業日 | ENKI DB-BA, INSD | あり | あり／あり |
| 酵母: 26S rDNA-D1/D2 Rapid | ENKI DB-FU, INSD | ||||
| カビ: ITS rDNA Rapid, 28S rDNA-D1/D2 Rapid | ENKI DB-FU, INSD | ||||
| カビ形態 Rapid | ー | ー | あり／なし | ||
| 細菌: 16S-500 Rapid | なし | ENKI DB-BA, INSD | あり | あり／あり | |
| 酵母: 26S rDNA-D1/D2 Rapid | ENKI DB-FU, INSD | ||||
| カビ: ITS rDNA Rapid, 28S rDNA-D1/D2 Rapid | ENKI DB-FU, INSD |
＊「ENKI DB-BA」および「ENKI DB-FU」は当社微生物同定データベース、「INSD」は国際塩基配列データベースを意味します。
ENKI DB-BA (細菌)／ENKI DB-FU (菌類): 当社微生物同定データベースについて
当社微生物同定データベースは、当社と国立遺伝学研究所との共同開発により国際塩基配列データベースに登録されている膨大なデータを吟味した上で、DB-BAでは基準株、DB-FUでは基準株とタイプ由来株 Ex-type strainなどを選抜して収録しています。
DB-BAとDB-FUの利点は、「菌種の絞り込み」に有効と考えられる塩基配列データで構築されていることから、有効な学名のみで相同性検索結果が表示されることにあります。