in silico DNA-DNA hybridization (in silico DDH) 解析

執筆者 | 10月 17, 2024 | 細菌, 細菌_ゲノム解析

in silico DNA-DNA hybridization (in silico DDH) 解析 ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 in silico DDH解析は、対照株と比較株の全ゲノム配列やドラフトゲノム配列をコンピュータ上で比較し、2株間の種の異同を評価する方法です。この試験はゲノムDNA抽出物を用いたDNA-DNAハイブリッド形成試験と正の相関があるとされています1,2)。近年ではin silico...

細菌DNA塩基配列解析・分子系統解析 (16S rDNA)

執筆者 | 10月 15, 2024 | 同定試験, 細菌, 細菌_同定, 細菌_研究, 細菌_衛生

細菌DNA塩基配列解析・分子系統解析 (16S rDNA) ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 細菌の同定に一般に用いられている16S rDNAでは、上流側の約500 bpの部分塩基配列で近縁種の同定がほぼ可能ですが、全長配列(Full)を解析する方がより同定の精度が高くなり、帰属種・近縁種の同定に優れます。特に、細菌を特許寄託する場合や新種提唱する場合には、1,300 bp以上のDNA塩基配列長による解析が必要となります。また、新種提唱などの論文投稿では、分子系統解析が必須となることがあります。当社では近隣結合法 (NJ;...

微生物同定システム「ENKI ®」- 相同性検索、系統解析ソフトウェア –

執筆者 | 10月 11, 2024 | 分析用製品, 研究, 細菌, 衛生, 製品・技術提供, 酵母

微生物同定システム「ENKI ®」- 相同性検索、系統解析ソフトウェア – ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 DNA塩基配列解析では、国際塩基配列データベース (INSD：DDBJ/ENA/GenBank) の利用がほとんどですが、膨大なDNA塩基配列データが蓄積されているために、微生物の同定に有効なDNA塩基配列データを選択するには多大な手間と時間を要します。また、微生物分類学の専門知識がなければ、微生物の同定が難しいケースが多々あります。当社では国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ (DNA Data...

Rapid解析・カビ形態Rapid

執筆者 | 10月 8, 2024 | 同定 (特急), 細菌, 衛生

Rapid解析・カビ形態Rapid ホーム / 製品及びサービス 特長 ※1　カビ形態Rapidは除く。※2　当社微生物同定データベースに対する相同性検索結果を報告します。※3　ENKI BLAST Rapid解析は対象外となります。 概要 医薬品や食品・飲料メーカーなどで衛生管理を担当され、特に迅速性を要求されるお客様におすすめです。DNA塩基配列解析には、当社が開発した微生物同定システム「ENKI®」を使用します。Rapid解析 (4営業日報告) は、当社の微生物同定データベースおよび国際塩基配列データベース...