細菌DNA塩基配列解析・分子系統解析 (16S rDNA)

執筆者 | 10月 15, 2024 | 同定試験, 細菌, 細菌_同定, 細菌_研究, 細菌_衛生

細菌DNA塩基配列解析・分子系統解析 (16S rDNA) ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 細菌の同定に一般に用いられている16S rDNAでは、上流側の約500 bpの部分塩基配列で近縁種の同定がほぼ可能ですが、全長配列(Full)を解析する方がより同定の精度が高くなり、帰属種・近縁種の同定に優れます。特に、細菌を特許寄託する場合や新種提唱する場合には、1,300 bp以上のDNA塩基配列長による解析が必要となります。また、新種提唱などの論文投稿では、分子系統解析が必須となることがあります。当社では近隣結合法 (NJ;...

細菌形態観察および生理・生化学的性状試験

執筆者 | 11月 7, 2023 | 細菌, 細菌_性状試験, 細菌_研究

細菌形態観察および生理・生化学的性状試験 ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 細菌の形態学的な特徴や生理・生化学的な性状を調べ、帰属分類群を同定することを目的とした試験です。複数の試験項目をセットにした細菌第一段階試験、細菌第二段階試験および放線菌生理・生化学的性状試験をご用意しています。 特に細菌第二段階試験では、事前にDNA塩基配列解析を実施している場合、その情報から最も有効な生理・生化学的性状試験項目を実施しますので、より詳細に近縁種と比較することが可能となります。 受入可能な検体...

Bacillus cereusグループ関連試験

執筆者 | 11月 7, 2023 | 細菌, 細菌_性状試験, 細菌_研究, 細菌_衛生

Bacillus cereusグループ関連試験 ホーム / 製品及びサービス 概要 B. cereus groupは、B. anthracis ( 炭疽菌) やB. cereus (セレウス菌) といったバイオセーフティーや感染症の予防および感染症の患者に対する医療に関する法律 (感染症法) の観点できわめて重要な菌種が含まれる微生物群です。しかしながら、B. cereus groupに含まれる菌種は16S rDNA塩基配列や形態学的特徴、生理・生化学的性状が類似していることがわかっています。また、近年多くのB. cereus...

細菌Premium

執筆者 | 11月 7, 2023 | 同定試験, 細菌, 細菌_同定, 細菌_研究

細菌Premium ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 16S rDNAの全長解析である「16S rDNA-Full」と「形態観察」や「生理・生化学的性状試験」などの性状試験を組み合わせたメニューです。DNA塩基配列解析のみの試験に比べ、より精度の高い帰属種・近縁種の推定が期待できます。学会発表や特許取得の際のデータ取得など、微生物株についてより詳細な情報を必要とするお客様に有効となり、当該微生物株の分類学的な特徴付けが可能です。 受入可能な検体...

細菌機能遺伝子解析 (単一機能遺伝子・MLSA)

執筆者 | 11月 7, 2023 | 同定試験, 細菌, 細菌_同定, 細菌_研究

細菌機能遺伝子解析 (単一機能遺伝子・MLSA) ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 機能遺伝子は、菌体細胞の維持や増殖に不可欠な酵素タンパクをコードする遺伝子やストレスタンパク遺伝子などを指し、16S rDNAに比べて進化速度が速く多型であることが知られています。16S rDNAでは菌種の識別が困難であった分類群においても、機能遺伝子を用いた分子系統解析により種レベル (亜種レベル) の同定が可能となることがあります。 分子系統解析手法は、主流である近隣結合法 (NJ; Neighbor Joining) のように距離行列...