生体 アンプリコンシーケンス解析 執筆者 tslseeqadmin | 9月 24, 2024 | 生体関連, 生体関連_菌叢解析, 群集構造解析生体 アンプリコンシーケンス解析 ホーム / アンプリコンシーケンス 特長 データ解析ソフトウェアは2種類から選択可能 【細菌・アーキアの場合】 セット1：Metagenome@KIN (データベース『RDP』あるいは『テクノスルガ・ラボ 微生物同定データベース』) セット2：QIIME2 (データベース『Greengenes』あるいは『SILVA』) 【カビ・酵母の場合】セット1：Metagenome@KIN (データベース『RDP』)セット2：QIIME2 (データベース『UNITE』) 概要...
生体 アンプリコンシーケンス解析 (JMBC 推奨プロトコル) 執筆者 tslseeqadmin | 11月 7, 2023 | 生体関連, 生体関連_菌叢解析, 群集構造解析生体 アンプリコンシーケンス解析 (JMBC 推奨プロトコル) ホーム / アンプリコンシーケンス 特長 解析ソフトウェアは2種類から選択可能 セット1：Metagenome@KIN (データベース『RDP』あるいは『テクノスルガ・ラボ 微生物同定データベース』) セット2：QIIME2 (データベース『Greengenes』あるいは『SILVA』) 概要 JMBC が推奨する糞便メタゲノム解析推奨プロトコル1,2)に基づき、アンプリコンシーケンス解析を実施します。 受入可能な検体...
T-RFLPフローラ解析 (MN法) 執筆者 tslseeqadmin | 11月 7, 2023 | 生体関連, 生体関連_菌叢解析, 群集構造解析T-RFLPフローラ解析 (MN法) ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 T-RFLP (Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism) は、末端蛍光標識したプライマーセットでPCR増幅したDNAを制限酵素処理後、その断片多型 (検出される蛍光ピークの数、強度と分子量) から細菌叢を推定します。微生物の分類体系がDNA塩基配列の差異と関係すること、それが制限酵素の切断パターンとして現れることを利用しています。...
