生体 アンプリコンシーケンス解析 (JMBC 推奨プロトコル)

執筆者 | 11月 7, 2023 | 生体関連, 生体関連_菌叢解析, 群集構造解析

生体 アンプリコンシーケンス解析 (JMBC 推奨プロトコル) ホーム / アンプリコンシーケンス 特長 解析ソフトウェアは2種類から選択可能 セット1：Metagenome@KIN (データベース『RDP』あるいは『テクノスルガ・ラボ 微生物同定データベース』) セット2：QIIME2 (データベース『Greengenes』あるいは『SILVA』) 概要 JMBC が推奨する糞便メタゲノム解析推奨プロトコル1,2)に基づき、アンプリコンシーケンス解析を実施します。 受入可能な検体...

T-RFLPフローラ解析 (MN法)

執筆者 | 11月 7, 2023 | 生体関連, 生体関連_菌叢解析, 群集構造解析

T-RFLPフローラ解析 (MN法) ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 T-RFLP (Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism) は、末端蛍光標識したプライマーセットでPCR増幅したDNAを制限酵素処理後、その断片多型 (検出される蛍光ピークの数、強度と分子量) から細菌叢を推定します。微生物の分類体系がDNA塩基配列の差異と関係すること、それが制限酵素の切断パターンとして現れることを利用しています。...

生体 リアルタイムPCR解析 (定量)

執筆者 | 11月 7, 2023 | 生体関連, 生体関連_定量・定性, 群集構造解析

生体 リアルタイムPCR解析 (定量) ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 検体中に含まれる特定の帰属分類群の遺伝子を、リアルタイムPCRシステムにより指数関数的に増幅するDNAの量をリアルタイムにモニタリングし、定量します。全細菌や全アーキアのコピー数と比較することで、検体中の標的菌群の割合を推定可能です。 受入可能な検体...

アンプリコンシーケンスデータ解析 (Metagenome＠KIN)

執筆者 | 11月 7, 2023 | データ解析, 群集構造解析

アンプリコンシーケンスデータ解析 (Metagenome＠KIN) ホーム / アンプリコンシーケンス 特長 概要 次世代シーケンサー (Next Generation Sequencer：NGS) を用いたアンプリコンシーケンス解析により得られた配列データの帰属分類群を推定するデータ解析です。 受入可能な検体...