生体 アンプリコンシーケンス解析 (JMBC 推奨プロトコル) 執筆者 tslseeqadmin | 11月 7, 2023 | 生体関連, 生体関連_菌叢解析, 群集構造解析生体 アンプリコンシーケンス解析 (JMBC 推奨プロトコル) ホーム / 群集構造解析 / 生体関連 特長 データ解析ソフトウェアは2種類から選択可能 概要 JMBC が推奨する糞便メタゲノム解析推奨プロトコル1,2)に基づき、アンプリコンシーケンス解析を実施します。 受入可能な検体...
T-RFLPフローラ解析 (MN法) 執筆者 tslseeqadmin | 11月 7, 2023 | 生体関連, 生体関連_菌叢解析, 群集構造解析T-RFLPフローラ解析 (MN法) ホーム / 群集構造解析 / 生体関連 / 生体関連_菌叢解析 特長 概要 T-RFLP (Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism) は、末端蛍光標識したプライマーセットでPCR増幅したDNAを制限酵素処理後、その断片多型 (検出される蛍光ピークの数、強度と分子量) から細菌叢を推定します。微生物の分類体系がDNA塩基配列の差異と関係すること、それが制限酵素の切断パターンとして現れることを利用しています。...
生体 リアルタイムPCR解析 (定量) 執筆者 tslseeqadmin | 11月 7, 2023 | 生体関連, 生体関連_定量・定性, 群集構造解析生体 リアルタイムPCR解析 (定量) ホーム / 群集構造解析 / 生体関連 特長 概要 検体中に含まれる特定の帰属分類群の遺伝子を、リアルタイムPCRシステムにより指数関数的に増幅するDNAの量をリアルタイムにモニタリングします。全細菌や全アーキアのコピー数と比較することで、検体中の標的菌群の割合を推定可能です。 受入可能な検体 A 区分 : 糞便検体...
生体 特異プライマーPCR解析 (定性) 執筆者 tslseeqadmin | 11月 7, 2023 | 生体関連, 生体関連_定量・定性, 群集構造解析生体 特異プライマーPCR解析 (定性) ホーム / 群集構造解析 / 生体関連 特長 概要 検体中に含まれる特定の帰属分類群や特定機能遺伝子をターゲットにしたプライマーセットを用いて、PCR増幅、電気泳動を行い、目的塩基長のバンドが出現することを確認して定性を行う試験です 受入可能な検体 A 区分 : 糞便検体...
糞便理化学分析 執筆者 tslseeqadmin | 11月 7, 2023 | 生体関連, 生体関連_理化学分析, 群集構造解析糞便理化学分析 ホーム / 糞便理化学分析 特長 概要 糞便理化学分析の各対象成分は、「必要検体量・分析対象成分/評価項目」に記載の評価項目を測定、分析します。 糞便中有機酸分析 (短鎖脂肪酸) 腸内において有機酸 (短鎖脂肪酸)...
生体 アンプリコンシーケンス解析 執筆者 tslseeqadmin | 11月 7, 2023 | 生体関連, 生体関連_菌叢解析, 群集構造解析生体 アンプリコンシーケンス解析 ホーム / アンプリコンシーケンスデータ解析 (QIIME2) 特長 [ 細菌は ]データ解析ソフトウェアは2種類から選択可能 [ 菌類は ]データ解析ソフトウェアは2種類から選択可能 概要...