アンプリコンシーケンスデータ解析 (Metagenome@KIN)

アンプリコンシーケンスデータ解析 (Metagenome@KIN) ホーム / 群集構造解析 / データ解析 特長 概要 次世代シーケンサー (Next Generation Sequencer:NGS) を用いたアンプリコンシーケンス解析により得られた配列データの帰属分類群を推定するデータ解析です 受入可能な検体...

アンプリコンシーケンスデータ解析 (QIIME2)

アンプリコンシーケンスデータ解析 (QIIME2) ホーム / 2019 特長 概要 QIIME21)は代表配列の決定から多様性解析まで、アンプリコンシーケンス解析に必要なソフトウェアをまとめたオープンソースの解析パイプラインです。解析結果はqzvという独自のファイル形式になり、専用のwebサイトQIIME2...

統計分析ソフトRによるデータ解析

統計分析ソフトRによるデータ解析 ホーム / 群集構造解析 / データ解析 特長 概要 アンプリコンシーケンス・データ解析、QIIME2解析、T-RFLPフローラ解析 (MN法) の各結果を基に、論文投稿や学会発表向けに必要な作図や統計学的検定を統計分析ソフトウェアR1,2)で実施します。 参考文献 (1) R Core Team. R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing...

PICRUSt2による予測メタゲノム解析

PICRUSt2による予測メタゲノム解析 ホーム / 群集構造解析 / データ解析 特長 概要 予測メタゲノム解析は、検体に含まれる細菌叢が持つ遺伝子の機能を予測する解析手法です。16S rRNA遺伝子(16S rDNA)のアンプリコンシーケンス解析データを用いて解析することができ、ショットガンメタゲノム解析の代替法として利用されています。PICRUSt21) による解析では、QIIME2で出力した代表配列とリード数を基に、細菌叢が持つ遺伝子の機能を予測します。 参考文献 (1) Douglas GM, Maff ei VJ....

腸内環境分析用 糞便採取キット・採取容器

腸内環境分析用 糞便採取キット・採取容器 ホーム / 製品・技術提供 / 糞便_採取製品 特長 概要 腸内細菌叢を解析する場合、採取した糞便の菌叢を安定的に維持する必要があります。 当社では被験者様がご自宅で採便しても、手順通りの採便で必要な便量を確保でき、室温のまま回収可能な採取容器を販売しております。 ブラシ型の採取容器は便潜血用を利用しており、固形便の採取に適し、アンプリコンシーケンス解析およびショットガンシーケンスの用途に適切な便量を確保できます。...

皮膚菌叢解析用採取キット メタフロキーパー (皮膚)

皮膚菌叢解析用採取キット メタフロキーパー (皮膚) ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 容易に皮膚常在菌の採取、保存を可能とした皮膚菌叢解析用採取キットです。糞便採取キットで使用している保存液を採用し、室温でも菌叢を維持できるようにしました。 本キットでは、生理食塩水に浸されたスワブの拭き取り面を変えながら皮膚を擦ることで皮膚常在菌を採取し、拭き取ったスワブを保存液に浸すことで、菌叢の変化を抑えます。粘着テープによる採取とは異なり、角質へのダメージも少なく採取可能です。 SDS  メタフロキーパー (皮膚) SDS...