MALDI微生物同定試験 (Biotyper)
特長
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当日午前中までの到着検体 (細菌・酵母の純粋培養物に限る) は、即日納品
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DNA塩基配列解析と比較し、迅速、低価格での報告が可能
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バイオセーフティレベル付きで報告
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細菌、カビ(糸状菌)、酵母のすべてのカテゴリーの同定に対応
概要
細菌、カビ、酵母のタンパク質マススペクトルを取得し、データベースと照合することで、検体の帰属種・近縁種を同定します。MALDI-TOF M S法は、迅速性やコストの低さから臨床・食品・製薬など様々な分野で普及が進んでいます。
細菌および酵母では、当社営業日の午前中に到着し、検体が純化された平板培養物、または解析を実施するコロニーやカテゴリーが明確であった場合には、ご送付検体より直接解析を行い、即日報告が可能です。
カビを対象にした試験では、タンパク質抽出を効率よく行うために液体培地での培養が必須となりますが、検体受領から培養を含めて、2〜4日で報告が可能です。また、DNA塩基配列解析に比べ安価ですので、コストを重視されるお客様におすすめです。
同時または追加で、DNA塩基配列解析をご希望される場合には「MALDI割」を適用します。
〈こんな方におすすめです〉
- まとまった検体数で同定を行いたいけれど、コストを抑えたい。
- DNA塩基配列解析を考えているが、事前にスクリーニングとして利用したい。
受入可能な検体
検体受付の前営業日17:00までに依頼書をE- メールにてお送り下さい。
検体の状態によっては即日報告できない場合があります。下表をご確認の上、検体をご送付ください。
カテゴリー | 必要量 | 送付方法 | 備考 |
細菌 | 純粋培養物※ ¹、² | 普通寒天培地、標準寒天培地、SCD 寒天培地など | 十分な生育を確認後、可能な限り早くお送りください※ ³。 参照情報【平板培養におけるコロニーの形成】 |
酵母 | YM 寒天培地、SCD 寒天培地など | ||
カビ※ ⁴ | PDA 培地、サブロー寒天培地など | 十分な生育を確認後、シャーレが開封しないようパラフィルム等で固定し、検体をお送りください。 参照情報【平板培養におけるコロニーの形成】 |
- カテゴリー変更やコンタミネーションなどに起因し、解析対象が試験当日の12:00までに確定できない場合、即日報告できません。
- １日の報告件数は10株を上限とします。10株を超える場合は翌日以降のご報告となります。その際は優先順位をご連絡ください。
※1 純粋な単一コロニーが認められない検体、液体培養物、混釈培養物、ペトリフィルム、選択培地で培養した検体などは直接解析できません。当社にて必要に応じて平板塗抹による再培養（有償）、または単離作業（有償）を行い、その後解析となります。再培養、単離作業を行う場合、MALDI微生物同定試験とは別に納期を必要とします。
※2 グルーピング (コロニー性状による同種／別種の判断) は有償での対応となります。MALDI微生物同定試験とは別に納期を必要とします。
※3 培養後、大幅に時間が経過している検体は解析に適しません。可能な限り培養24～48時間の微生物株をお送りください。
※4 当社にて解析前に培養を行いますので、培養後時間が経過している微生物株でも生育が認められれば解析可能です。
解析の流れ
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純度確認
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培養 (カビの場合)
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サンプル調製
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解析 ライブラリサーチ
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レポート作成
納品内容
試験項目 | 報告内容 |
MALDI 微生物同定試験 (Biotyper) | • データベースとの照合結果から推定される候補菌種 ( 同定結果 ) |
報告書サンプル
使用データベースと対象微生物
データベース | 対象微生物 |
MBT Compass® Library | 細菌、 酵母、 カビ ( 糸状菌 ) |
MBT Filamentous Fungi Library | カビ ( 糸状菌 ) |
「Main Spectra(MSP)」を基本コンセプトとし、各微生物株を複数回測定して各ピーク(分子量)とその強度の平均値を算出取得しています。マススペクトルのうち、検出頻度の低いピークはノイズとして除去して検出頻度の高い特徴的なピークのみを用いてデータベースを構成しています。同一菌種でも複数株のマススペクトルデータが登録されているため、菌株間でマススペクトルパターンに多様性がある場合でも正確な同定が可能とされています。
価格・納期
年間契約割引( 年間150 株以上) もご用意しております。
試験項目 | 株数 | 単位 | 単価 | 納期※ ³ |
・MALDI 微生物同定試験 | 1～3 | 株 | 6,500 円 | 即日 18:00まで ( 月～金曜日の午前中までに到着および試験実施可能と判断された検体、純粋培養物・オンライン納品に限ります ) |
4～10 | 株 | 6,000 円 | ||
11～20 | 株 | 翌営業日となる場合があります | ||
21～ | 株 | お問い合わせ下さい | ||
・MALDI 微生物同定試験 | 1～3 | 株 | 11,000 円 | 以下参照 |
4～10 | 株 | 9,500 円 | ||
11～ | 株 | お問い合わせください | ||
カビ解析 ・ 報告納期 | |||||
検体到着日 | 月曜日 | 火曜日 | 水曜日 | 木曜日 | 金曜日 |
解析 ・ 報告日※ ¹、² | 木曜日または金曜日 | 翌週の月曜日または火曜日 | |||
※1 報告日が休業日の場合、翌営業日の報告となります。
※2 培養(目安日数:2〜3日)において生育が充分と判断した日に試験を開始します(翌営業日報告)。試験の可否判断は、当社に一任下さい。
※3 原則18:00までにご報告します。状況によっては18：00以降の報告となる場合があります。
DNA塩基配列解析をお得なセット価格で
プラス「DNA塩基配列解析」でMALDI 微生物同定試験の解析結果をカバーします!
DNA塩基配列解析と組み合わせることで、MALDI微生物同定試験のデータベースに登録のない菌種も同定できます。
ご依頼時、「試験と同時」または「試験の結果を見てから必要に応じて開始」をご選択いただけます。
■適用可能なDNA塩基配列解析※
| カテゴリー | 適用可能なDNA塩基配列解析 | お急ぎの場合 |
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DNA塩基配列解析 16S rDNA-500 ( BLAST) 16S rDNA-500 16S rDNA-500 (＋考察付オプション) |
Rapid解析(DNA特急) 16S rDNA-500 ( ENKI B LAST) Rapid 16S rDNA-500 Rapid |
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DNA塩基配列解析 ITS rDNA ( BLAST) ITS rDNA ITS rDNA (＋考察付オプション) |
Rapid解析(DNA特急) ITS rDNA Rapid |
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DNA塩基配列解析 26S rDNA-D1/D2 ( BLAST) 26S rDNA-D1/D2 26S rDNA-D1/D2 (＋考察付オプション) |
Rapid解析(DNA特急) 26S rDNA-D1/D2 ( ENKI B LAST) Rapid 26S rDNA-D1/D2 Rapid |
※ 酵母は26S rDNA-D1/D2をITS rDNAに、カビはITS rDNAを28S rDNA-D1/D2に領域変更可能です。
試験項目 | 単価 | 検体受付、納期、納品形式など |
追加DNA 塩基配列解析 | 各試験項目の12％割引 | 各試験項目によります |
オプション クラスター分析・スペクトルパターン
クラスター分析は、お客様専用のユーザーデータベースを作成し、登録したスペクトルデータからデンドログラムを作成し、検体間の類似度を可視化します。MALDI Bioty perのクラスター分析の場合、「●％以上で同一種」といった明確な数値基準がないため、デンドログラムから各検体の種の異同を判断することはできませんが、複数の検体を大まかにグルーピングすることが可能です。また、MALDI微生物同定試験で同定できなかった検体をDNA塩基配列解析し、クラスター分析の結果に反映させることで、未同定株の種を推定することも可能です。
スペクトルパターンでは、PDF形式のマススペクトルデータの画像とExcel形式のピークリストを出力し、報告します。
試験項目 | 報告内容 | 単価 ( 税抜 ) | 目安納期 |
クラスター分析※ ¹、²、³ | お客様専用のユーザーデータベースを作成し、登録したスペクトルデータからクラスター分析を行います。デンドログラムを作成することで、検体間の類似度が可視化できます。 | ＋ 4,000 円 | ＋ 2 営業日～ |
スペクトルパターン | マススペクトルデータの画像 (PDF 形式) とピークリストを (Excel 形式) | ＋ 3,000 円 | ＋ 1 営業日～ |
※2 MALDI微生物同定試験と同時依頼に限ります。クラスター分析の結果はMALDI微生物同定試験の報告書に含みます。
※3 ユーザーデータベースの株数が100株以上となる場合には、納期を延長することがあります。
関連ページ
| Rapid解析・ カビ形態Rapid |
２，DNA塩基配列解析（通常納期）をご検討の方には、以下の試験項目がございます。
| 細菌DNA塩基配列解析・分子系統解析 (16S rDNA) | カビDNA塩基配列解析・分子系統解析 | 酵母DNA塩基配列解析・分子系統解析 |
ご依頼前の同意事項
・ 見積書・注文書の取り交わしを省略し、依頼書および検体の到着をもって注文とし、試験を開始します。
・ 10検体までは即日、11～20検体は翌営業日の報告となります。21検体以上の場合には、お問い合わせ下さい。
・ 報告書分冊の場合は、ご依頼の際にご指示をいただく必要があります。また、報告日は翌営業日となる場合があります。
・ 報告書に付属している結果データファイルの検体ごとの分割はできません。
・ カビの試験を行う場合、サブロー液体培地による培養が必須となります。即日報告ではありません。
・ コンタミネーションにより単離の必要がある検体は、別途有償での作業が必要となります。
・ 検体受付の前営業日17:00までに依頼書の到着がない場合、所定の日数での報告ができないことがあります。
・ データベースの菌種のタンパク質マススペクトルとのパターンマッチングによる試験のため、登録されている菌種と異なる菌種であっても、類似のマスス
ペクトルを示した場合にはその菌種が検体の同定結果として得られることがあります。また、登録されている菌種であっても、検体のタンパク質組成に
よっては、同定結果が得られない、または異なる菌種として同定結果が得られることがあります。
・ スラント、保存アンプル作製などの培養を含む追加試験を行う場合、別途、検体の再送をお願いすることがあります。
・ カビ・酵母の場合、テレオモルフ(有性時代)とアナモルフ(無性時代)の判別はできません。
・ 非常に近縁な菌種または亜種が存在する検体は、本試験により区別できないことがあります。
・ プロトコルは、ブルカージャパン株式会社の推奨に基づきます。
・ ご依頼前の同意事項(共通)を必ずご確認下さい。
・ バイオセーフティレベルは、細菌「日本細菌学会バイオセーフティ指針」、カビ・酵母「Atlas of clinical fungi」または「各微生物株保存機関の情
報」 を採用しています。他の機関や海外の情報とは異なる場合があります。
・ バイオセーフティレベルは、病原体の危険度レベルに基づく分類です。結果に報告されるバイオセーフティレベルは、当社がその安全性(危険性)を保証
するものではありません。
・ バイオセーフティレベルは、各微生物種に対し定められています。報告書で示すバイオセーフティレベルは目安であり、検体自体のバイオセーフティレベ
ルを示すものではありません。